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CRISPR技術將數據(jù)存(cún)入活細胞DNA

作者:     發布日期: 2021-01-15     二維(wéi)碼分享

據*新(xīn)一期《自然·化學生物學》雜誌報道,美國研究人員通過CRISPR技術,將數字電子信號直接轉換為存儲在(zài)活(huó)細胞基因組中(zhōng)的遺傳數據,這或是邁(mài)向開(kāi)發用於長(zhǎng)期(qī)數據存(cún)儲新介質的關鍵一步。

美國哥倫比亞大學研究團隊(duì)使用CRISPR基因編輯技術,將編碼二進製(zhì)數據(計算機用來存儲數據(jù)的1和0)的特定DNA序列插入細菌細胞。通過將這些DNA序列的不同排列分配給不同英文字母,研究人員(yuán)將文本消息“hello world!”成功編碼進了大腸杆菌細胞內的DNA中。研究(jiū)團隊隨後通過提取和測序細菌DNA解碼了該消息。

該項工作建立在研究團隊先前為大(dà)腸杆菌設計的基於(yú)CRISPR的細胞記錄儀的基礎上,該記錄儀檢測細胞內(nèi)某些DNA序列的(de)存在並將該信號記錄到生物體的基因組中。該係統包括一個基於DNA的“傳感(gǎn)模塊”,該模塊響應特定的生物信號而產生高水平的“觸發序列”。這些序列被並入記錄儀的“DNA錄音帶”中(zhōng)以記(jì)錄(lù)信號。

研究團隊在(zài)新研究(jiū)中對傳感模(mó)塊進行了改裝,使其可以與另一個對電信號作出反應的生物傳感器配合使用(yòng)。然(rán)後將大量(liàng)細菌放入由一係列(liè)小單元組成的(de)設備中,並暴露於電信號(hào)下。

當施(shī)加電壓時(shí),觸發序列的水平升高,並記錄在DNA條形記(jì)錄帶中。將具有高比例觸發序列的(de)延伸片段表示為二(èr)進製“1”,缺少這些序列則記為“0”,由(yóu)此可將數字信息直接編碼到細菌的基因組中。

一個單元可以容納(nà)的(de)數據量很小,隻有3位。因(yīn)此,研究人員設計了一種(zhǒng)方法,可以同時對具有不同3位(wèi)數據的24個單獨細菌群(qún)進行編碼,共計72位。研究人員用它將文本消息“hello world!”編碼入(rù)細菌,並演(yǎn)示(shì)了對合並菌群進行測序並使用專門設計的(de)分類器(qì),可以98%的準確率檢索到該信息。

研究人員表(biǎo)示,活細胞內的DNA是一種更穩定的介質(zhì),可以在(zài)無法預測的條件下長期保存。保留在細(xì)胞外部的DNA可能被降解,而細菌具有適應環境變化的能力,並且可在惡劣的條件下生(shēng)存。將數據(jù)存儲在細胞中而不是在(zài)體(tǐ)外具有許多明顯的好處。放大或複製數(shù)據要便(biàn)宜得多,因為可以簡單地培養更(gèng)多的細胞,而不必進(jìn)行複雜的人工DNA合成,從而在短期內(nèi)就可將係統(tǒng)的容量大規模擴展幾個數量(liàng)級。

總編輯(jí)圈點

基因物質本身就(jiù)具備天然的數據存儲介質,因此“活細胞硬(yìng)盤”的想法,科學家早已有之。但在實際操作中,這(zhè)一方式(shì)距離傳統硬盤的存儲容量還有距離(lí)。不過,活細胞一(yī)直能被視為下一代存儲設(shè)備中的潛力股,原因就(jiù)是它的穩(wěn)定(dìng)與長期存儲特性(xìng),科學家寄希望於未(wèi)來可利用其進行長時(shí)間的分子事件記錄和監(jiān)控,從而進一步成(chéng)為人類研究癌症、衰老和有機(jī)體發展(zhǎn)等的強大工具。(記者馮衛東)

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