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CRISPR技術將數據存入活細胞DNA

作者:     發布日期: 2021-01-15     二維碼分享(xiǎng)

據*新一期《自然(rán)·化學生物學》雜誌報道,美國(guó)研究人員通過CRISPR技術,將數字電子信號直(zhí)接轉換為存儲在活細胞基因組中的遺傳(chuán)數據,這或是邁向開發用於長期數據存儲新介質(zhì)的關鍵一步。

美國哥倫(lún)比亞大學研究團隊使用(yòng)CRISPR基因編(biān)輯技術,將(jiāng)編碼二進製數據(計算機用來存儲(chǔ)數據的(de)1和0)的特定DNA序列插入細菌細胞。通過將這些DNA序列的不(bú)同排列分配給不同英文字母,研究人員將文(wén)本消息“hello world!”成功(gōng)編碼進了大腸杆菌(jun1)細胞內的DNA中。研究團隊隨後通過提取和測序(xù)細(xì)菌DNA解碼(mǎ)了該消息(xī)。

該項工作建立在研究團隊先前為大腸杆菌設計的基於(yú)CRISPR的細胞記錄儀的基(jī)礎上,該記錄儀檢測細胞內某(mǒu)些DNA序列的存在並將該(gāi)信號記錄到生物體的(de)基因組中。該係統包括一個基於DNA的(de)“傳感模塊”,該模塊響應特定的生物信號而(ér)產生高水平的“觸發序列”。這些序列被並入記錄儀的“DNA錄音帶”中以記錄信號(hào)。

研究團隊在新研究中對(duì)傳(chuán)感模塊進行(háng)了改裝,使其可以與另一個對電(diàn)信號作出反應的生物傳感器配合使用。然後將大量細菌放入由一係列(liè)小單元(yuán)組成的設備中,並暴露於(yú)電信號下。

當施加電壓時,觸發序列的水(shuǐ)平升高,並記錄在(zài)DNA條形(xíng)記錄帶中(zhōng)。將具有高比例(lì)觸發序列的延伸(shēn)片段表示為二(èr)進製“1”,缺少這些(xiē)序列則記為“0”,由此可將數字信息直接編碼到(dào)細菌的(de)基因組中。

一(yī)個單(dān)元(yuán)可以容納的數據量很小,隻有3位。因(yīn)此,研究人(rén)員設計了一種方法,可以同時對具有不同3位數據的(de)24個單獨細菌群進行編碼,共計72位。研究人員用它將文(wén)本消息“hello world!”編碼入細菌,並演示了對合並菌群進行測序並使用專門設計的(de)分(fèn)類器,可以98%的準確率檢索到該信息。

研(yán)究人員表示,活細胞內的DNA是一種更穩定的(de)介質,可以在無法預測的條件下長期(qī)保(bǎo)存。保留在細胞外部的DNA可能被降解,而細菌具有(yǒu)適應環境(jìng)變化的能力(lì),並且可在惡劣的條件下生存。將數據存儲在細胞中(zhōng)而不(bú)是在體外具有許多明顯(xiǎn)的好處。放大或複製數據要便宜得多,因為可以(yǐ)簡單地培養更多的細胞,而不必進行複(fù)雜(zá)的(de)人工DNA合成,從而在短期內就可將係統的容量(liàng)大規模(mó)擴展幾個數量級。

總編輯圈點

基因物質本身就(jiù)具備天然的數據存儲(chǔ)介質,因(yīn)此(cǐ)“活細胞硬盤”的想法,科學家早(zǎo)已有之。但在實際操(cāo)作中,這一(yī)方式距離傳統硬盤的存儲容量還(hái)有距離。不過,活細胞(bāo)一直(zhí)能被視(shì)為下(xià)一代存儲設備(bèi)中的潛力股,原因就是它的穩定與長期存儲特性,科學家寄希望於未來可利(lì)用其(qí)進行長時間(jiān)的分(fèn)子事件記錄和監控,從而進一步成(chéng)為人類研究癌症、衰老和有機體發展等的強大工具(jù)。(記者馮衛東)

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